Rozbudowa zakładu zakończyła się w 2012[13]. Koszt rozbudowy oczyszczalni, budowa zakładu spalania osadów oraz ułożenie systemu rur dostarczających ścieki wyniósł ok. 3,7 mld zł[14]
. Była to jedna z największych stołecznych inwestycji współfinansowanych ze środków Unii Europejskiej[15]. Po jej zakończeniu „Czajka” stała się największą oczyszczalnią ścieków w Polsce.
Rozbudowany zakład zajmuje powierzchnię 52,7 ha[7] i może przyjąć 435 tys. m3 ścieków na dobę[3].
Pierwszym etapem oczyszczania ścieków jest oczyszczanie mechaniczne[7]. Ścieki trafiają na kraty, następnie do piaskowników i do osadników wstępnych[7]. W drugim etapie są kierowane do basenów osadu czynnego[7].
Tam usuwany jest z nich azot i fosfor[7]. Z basenów ścieki trafiają do osadników wtórnych, w których osad czynny oddzielany jest od ścieków, które następnie odprowadzane są do Wisły.